La Universidad Nacional de Colombia, la Universidad del Rosario, la Pontificia Universidad Javeriana, la Universidad de los Andes y la Universidad de Antioquia son las cinco mejores universidades en investigación científica en Colombia, según SCImago Institutions Rankings (SIR), una clasificación de la organización SCImago relacionada con el análisis de la investigación de 5.147 instituciones. Estas universidades colombianas se ubican dentro de las 100 instituciones con mejores resultados a nivel regional. Dentro de ellas se destaca la Universidad del Rosario y la Nacional que ocupan el puesto 26 y 29 respectivamente. En Colombia, 19 instituciones lograron ingresar al ranking.El ranking SIR 2016, clasificó a las 5.147 instituciones que publicaron al menos 100 investigaciones científicas en la base de datos Scopus, la mayor base de datos de referencias bibliográficas de literatura científica. La clasificación se realizó con base en la combinación de tres indicadores: resultados de las investigaciones desarrolladas, innovación y su impacto social; este último se midió a través de la visibilidad de su página.Entre las primeras, el SIR de este año ubicó al Centro Nacional de Investigación Científica de Francia, la Academia China de Ciencias y la Universidad de Harvard como las mejores instituciones científicas en el mundo. Para América Latina, el primer lugar se lo llevó la Universidad de Sao Paulo en Brasil, el segundo puesto lo obtuvo el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas de Argentina y el tercero lo ocupa la Universidad Estatal de Campinas, Brasil. Ranking mundial Centre National de la Recherche Scientifique (Francia) Chinese Academy of Sciences (China) Harvard University (Estados Unidos) National Institutes of Health (Estados Unidos) Standford University (Estados Unidos) Helmmholtz Gemeinschaft (Alemania) Max Planck Gesellschaft (Alemania) University of California (Estados Unidos) Johns Hopkins University (Estados Unidos) Massachusetts Institute of Technology (Estados Unidos)Ranking en Colombia Universidad del Rosario - (puesto 563) Universidad Nacional de Colombia - (puesto 570) Universidad de los Andes - (puesto 586) Universidad de Antioquia - (puesto 598) Pontificia Universidad Javeriana - (puesto 623) Universidad Industrial de Santander - (puesto 634) Universidad del Valle - (puesto 656) Universidad del Cauca - (puesto 662) Universidad del Norte - (puesto 666) Universidad Tecnológica de Pereira - (puesto 669)