Para tal efecto, la Registraduría Nacional instaló 9.438 mesas, ubicadas en 4.428 puestos de votación en el territorio colombiano.Los comicios electorales se caracterizaron por la baja participación de sufragantes. Estadísticamente solo votaron el 2,12 por ciento de un censo de 35.091.924 inscriptos, lo que equivale a decir que únicamente 744.521 personas salieron a ejercer su derecho al voto.  De esos 744.521 votos, 365.658 correspondieron a De la Calle y 324.777 para Juan Fernando Cristo. El resto concernió a los votos nulos (40.961) y a los votos no marcados (13.125). La diferencia fue de 40.881 papeletas. De la Calle —pese al ausentismo y a lo criticada que fue la consulta, por su costo de 40.000 millones de pesos— se impuso a Juan Fernando Cristo. La Registraduría emitió el boletín número 4 a eso de las 6:21 p. m., y prácticamente, escrutadas el 98,5 por ciento de las mesas, De la Calle era el indiscutible ganador. Los amigos más cercanos y la familia de De la Calle se dieron cita en el salón Real del hotel JW Marriot junto a  personalidades de la vida pública como Antanas Mockus, Rudolf Hommes y el mismo Juan Fernando Cristo, quienes felicitaron al triunfador de la Consulta Popular.